More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7125 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  100 
 
 		 229 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  30.7 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  36 
 
 		 227 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  38.79 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  33.63 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  33.51 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  32.2 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  34.86 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  36.88 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  31.86 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  37.66 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  36.65 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  35.19 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  28.04 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 180 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  26.02 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  31.3 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 198 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  26.28 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  34.4 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  25.24 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.77 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  25 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  26.28 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  26.28 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  26.28 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  26.28 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  25 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  23.08 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  25 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  26.37 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.89 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  25.32 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  27.56 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  29.2 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.75 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  27.75 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  30.51 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  26.67 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  37.07 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  25.89 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.52 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  27.56 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  32.74 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  26.61 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  32.74 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  32.74 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  27.83 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>