More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4590 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  100 
 
 		 177 aa  366  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  76.33 
 
 		 178 aa  270  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  51.53 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  44.31 
 
 		 172 aa  157  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 186 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  33.93 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 193 aa  97.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 182 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  37.75 
 
 		 180 aa  95.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  33.33 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  32.74 
 
 		 187 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  40.28 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  36.11 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  30.94 
 
 		 210 aa  91.3  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  36.6 
 
 		 313 aa  90.9  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  35.97 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 316 aa  89.4  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  35.81 
 
 		 240 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 228 aa  85.5  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 182 aa  85.1  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 		 182 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 207 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  35.81 
 
 		 217 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  39.1 
 
 		 186 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  29.66 
 
 		 190 aa  84.3  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  35.53 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  34.84 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 221 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 221 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  31.55 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 		 289 aa  77.8  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  29.3 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  35.81 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  34.46 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  26.76 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  31.97 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  32.68 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  30.71 
 
 		 216 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.87 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  31.64 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  32.9 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  32.9 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  30.87 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  29.94 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  30.77 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  31.11 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  30.51 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>