More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0815 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  59.68 
 
 		 184 aa  227  8e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  59.02 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  35.6 
 
 		 285 aa  85.9  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  34.55 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  34.55 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  34.55 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  34.55 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  34.55 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  34.55 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  34.55 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  34.55 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  33.5 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.03 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  28.35 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  30.27 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  30.85 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  29.19 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  31.82 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  30.21 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  31.89 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  29.69 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  29.79 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  31.64 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  30.26 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  31.55 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  31.55 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  31.55 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  31.55 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  28.87 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  31.55 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  29.69 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  28.8 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  28.8 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  28.8 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  29.17 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  28.8 
 
 		 295 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  28.8 
 
 		 295 aa  72  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  28.8 
 
 		 295 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  27.92 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.52 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  30.81 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.43 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  27.74 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  27.92 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  26.53 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  26.53 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  30.94 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  25.45 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  29.63 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  32.82 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  28.04 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  27.75 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  28.65 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  28.65 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>