More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1017 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 222 aa  434  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  40.28 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 185 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 184 aa  88.2  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  24.76 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  27.01 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  25.67 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.97 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  25.13 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  26.54 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  31.07 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  31.07 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  31.07 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  31.07 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  31.07 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  27.84 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  32.64 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  39.64 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  24.53 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  30.41 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  30.41 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  30.41 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  30.41 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  30.41 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  32.62 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2184  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  30.58 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  30.49 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  29.31 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  30.1 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  24.76 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  26.9 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  28.48 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  26.18 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.82 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  29.38 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  24.73 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  30.49 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  24.17 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  26.67 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  24.29 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  29.11 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  37.01 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  29.9 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  25 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  28.02 
 
 		 533 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1996  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  22.86 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  26.13 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  26.28 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.37 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>