More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  93.94 
 
 		 198 aa  376  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  69.7 
 
 		 198 aa  270  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  68.69 
 
 		 197 aa  266  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  64.32 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  62.63 
 
 		 196 aa  241  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  58.76 
 
 		 196 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  58.76 
 
 		 196 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  58.76 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  57.73 
 
 		 196 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  61.62 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  48.45 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  49.74 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  46.39 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  46.19 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  50.75 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  42.71 
 
 		 199 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  50.3 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  43.78 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  38.07 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  41.8 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  41.27 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  38.74 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  35.42 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  39.58 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  37.85 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  36.55 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  41.27 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 289 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  37.31 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  35.18 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  35.18 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  36.98 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.6 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  34.73 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  30.68 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  30.46 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  31.03 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 181 aa  95.5  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  37.71 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  36.09 
 
 		 181 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.46 
 
 		 187 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  30.46 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.46 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  30.46 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  30.46 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  35.19 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  31.03 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  31.03 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 184 aa  91.3  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  33.15 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  28.25 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  30.99 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  34.27 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  31.03 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  32.07 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  37.86 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  35.5 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  29.89 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  37.86 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>