More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2611 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  98.64 
 
 		 221 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  91.12 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  87.86 
 
 		 217 aa  358  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  86.89 
 
 		 240 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  62.8 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  63.29 
 
 		 210 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  59.13 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  64.56 
 
 		 210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  57.14 
 
 		 219 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  57.14 
 
 		 219 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  58.57 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  59.13 
 
 		 209 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  55.73 
 
 		 193 aa  221  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  57.58 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  46.8 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  51.91 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  49.18 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  47.25 
 
 		 342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 187 aa  161  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  48.7 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  42.02 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  37.85 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  35.91 
 
 		 181 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  40.15 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  40.15 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  40.15 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  39.42 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  31.43 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  34.62 
 
 		 182 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  32.58 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 184 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  38.03 
 
 		 172 aa  85.1  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 181 aa  84.7  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  34.25 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  34.42 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  29.67 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.21 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.21 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.21 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  29.51 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  31.28 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.21 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 174 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  30.05 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  34.32 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  31.79 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  30.64 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  38.03 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  29.88 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2860  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.258884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  29.27 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  29.51 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>