More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0829 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
244 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  59.07 
 
 
203 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  57.94 
 
 
203 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  58.6 
 
 
211 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  58.6 
 
 
211 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  56.54 
 
 
203 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  52.36 
 
 
234 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  51.17 
 
 
289 aa  204  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  52.31 
 
 
216 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  47.33 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  47.01 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  47.01 
 
 
231 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  49.07 
 
 
231 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  48.83 
 
 
228 aa  187  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  43.46 
 
 
207 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  42.13 
 
 
218 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  31.28 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
181 aa  91.7  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  36.55 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  32.8 
 
 
185 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
182 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 
240 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
181 aa  85.9  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 
182 aa  85.1  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 
184 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 
186 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  33.16 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 
182 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  29.02 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  29.02 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  29.02 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  35.4 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  33.51 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  27.46 
 
 
181 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  29.31 
 
 
316 aa  78.6  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 
181 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.16 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 
201 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.36 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  33.51 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.46 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  30.65 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 
199 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  32.32 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  34.6 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  31.18 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  26.94 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  26.42 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  26.42 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  26.42 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.1 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.1 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.1 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.18 
 
 
359 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  29.88 
 
 
176 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  26.15 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  28.8 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  32.81 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  32.43 
 
 
533 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  27.18 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  26.15 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  33.03 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  31.71 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30.57 
 
 
181 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  26.15 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  26.15 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>