More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0488 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  63.37 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  62.96 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  63.86 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  59.31 
 
 		 209 aa  248  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  57.42 
 
 		 219 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  57.42 
 
 		 219 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  60 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  60 
 
 		 240 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  60.7 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  58.5 
 
 		 221 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  58.5 
 
 		 221 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  58.5 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  54.68 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  54.55 
 
 		 201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  54.73 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 211 aa  201  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  48.91 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  49.18 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  49.75 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  45.65 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  46.41 
 
 		 342 aa  158  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 289 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  31.82 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  32.97 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2860  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.258884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25.56 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  32.79 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  38.24 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  24.44 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  34.44 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  26.4 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  27.62 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  37.32 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  32.03 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  30.9 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  27.07 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  27.07 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  26.52 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  26.52 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  26.52 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  27.07 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  25.56 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  31.45 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  26.92 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  31.03 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  27.47 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  26.52 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  26.92 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>