89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2860 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2860  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.258884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  32.58 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 342 aa  72  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3858  hypothetical protein  31.88 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191363  normal  0.585627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  29.38 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  26.14 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  28.98 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  26.14 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  26.14 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  25.41 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  28.17 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  23.31 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  21.71 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  26.74 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  30.07 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  26.34 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  25.37 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  22.7 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 173 aa  48.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  27.63 
 
 		 172 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  23.32 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  27.74 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  24.55 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  22.09 
 
 		 359 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  24.46 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 316 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  24.55 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2931  hypothetical protein  31.43 
 
 		 180 aa  45.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  24.14 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  31.43 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  25.75 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  29.03 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  26.57 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  24.61 
 
 		 225 aa  42  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  23.56 
 
 		 231 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  30.87 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  24.12 
 
 		 248 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  26.14 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  21.47 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  28.11 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  22.28 
 
 		 224 aa  41.2  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>