37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3858 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3858  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191363  normal  0.585627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2860  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.258884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  23.5 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  24.86 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  25.71 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  24.28 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2931  hypothetical protein  23.84 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  26.15 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  25.69 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  25.86 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  25.36 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  21.74 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  23.19 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  22.94 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  24.66 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  26.62 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  24.24 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  23.97 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  25.45 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  21.52 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  21.94 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  28.23 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  23.29 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  23.29 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  23.29 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  24.29 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  23.08 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  21.79 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  24.29 
 
 		 316 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  26.21 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  23.57 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>