More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0508 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0168  isochorismatase hydrolase  34.56 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  29.25 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 182 aa  72  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  27.03 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.14 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  28.38 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  26.62 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.74 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  27.63 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  27.81 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  25.85 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0226  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  27.81 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  24.03 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  32.05 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.65 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.65 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  29.27 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  24.03 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.65 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  28.65 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  25.38 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  28.65 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.65 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.21 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.65 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.65 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.32 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  28 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  26.51 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  26.14 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  26.14 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  25.78 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  26.14 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.29 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  26.14 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  25.85 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.29 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.29 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  24.03 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  25 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  25.52 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  23.65 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  39.39 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  25.81 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  23.65 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  31.29 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  25.49 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  25.49 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  27.38 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.57 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  29.66 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  25.32 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  25.49 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>