95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0226 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0226  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 150 aa  309  5.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0168  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 223 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 183 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  37.88 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  34.21 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  37.88 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0482  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.717591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  37.88 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  37.88 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  37.88 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  37.88 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  35.14 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  34.85 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06921  isochorismatase hydrolase family protein  24.53 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.467338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 183 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  37.88 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13441  isochorismatase hydrolase family protein  23.27 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  36.92 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03809  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03770)  33.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.347235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  29.87 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 		 192 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.78 
 
 		 359 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  36.92 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  31.58 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 208 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  28.38 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  35.38 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  26.95 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  26.24 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  40.91 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  27.92 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  28.68 
 
 		 176 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  28.95 
 
 		 184 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 190 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  28.68 
 
 		 176 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  26.37 
 
 		 192 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  28.68 
 
 		 176 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 180 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 184 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  30.56 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0636  isochorismatase hydrolase family protein  22.88 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.521489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 215 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  29.23 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  27.03 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  28.81 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  26.25 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  28.81 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  28.99 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  25 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 207 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 203 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 204 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27696  predicted protein  31.07 
 
 		 211 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.042891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 231 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 231 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  25.81 
 
 		 161 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  28.21 
 
 		 188 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>