188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6438 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  91.75 
 
 		 194 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  69.73 
 
 		 192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  60.32 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  55.19 
 
 		 208 aa  214  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 		 204 aa  211  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  53.4 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  55.49 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  53.93 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  51.65 
 
 		 203 aa  198  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  50.55 
 
 		 208 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  50.85 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  43.64 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  29.23 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  31.96 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.25 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0482  isochorismatase hydrolase  38.14 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.717591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  46.15 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 246 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  38.03 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  28.17 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 224 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0612  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 256 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0168  isochorismatase superfamily hydrolase  29.79 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  33.05 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  40.58 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.54 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1095  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  28.28 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  40.28 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1166  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 226 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0226  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  24.53 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0416  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0726879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.41 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1040  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0669  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  22.99 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0310  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.65 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2458  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1088  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  30.56 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  30.56 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1499  isochorismatase hydrolase  38.37 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  30.56 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1270  isochorismatase hydrolase  25.66 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0168  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  40 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  26.63 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  25.17 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.52 
 
 		 239 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3089  isochorismatase hydrolase  24.55 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.77 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  31.54 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>