29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9030 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  53.66 
 
 		 194 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  43.64 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  44.96 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 203 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  44.12 
 
 		 203 aa  95.9  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  44 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  46.32 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  46.32 
 
 		 203 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  39.62 
 
 		 204 aa  92  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  46 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  40.38 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  46.88 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  40.43 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  37 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  41.49 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 		 192 aa  45.8  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  36.23 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.25 
 
 		 197 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 		 207 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  25.83 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>