More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1758 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  66.11 
 
 		 203 aa  248  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  63.33 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  61.11 
 
 		 204 aa  238  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  62.78 
 
 		 208 aa  237  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  61.11 
 
 		 204 aa  236  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  58.1 
 
 		 203 aa  231  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  57.54 
 
 		 203 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  55.31 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  55 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  52.54 
 
 		 192 aa  194  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  51.67 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  49.72 
 
 		 192 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  50.85 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  50.85 
 
 		 194 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  45.56 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  37 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  33.7 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  31.32 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  41 
 
 		 226 aa  62  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  41 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  26.37 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  41 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  39.74 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  41.03 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  49.28 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  49.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  49.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  41.98 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  34.58 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  34.58 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  34.58 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  41.54 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  47.83 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  41.54 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  41.54 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  45.61 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  47.3 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  36.47 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  35.61 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  48.15 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  38.46 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  32.95 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  34.65 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  35.24 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  33.04 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  33.66 
 
 		 256 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  38.1 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 239 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  34 
 
 		 231 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3806  isochorismatase superfamily hydrolase  38.68 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.392907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 		 247 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 228 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  29.35 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  44.59 
 
 		 216 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  37 
 
 		 223 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 		 231 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  37.62 
 
 		 228 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  32 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  25.83 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.38 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  25.83 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.14 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1656  isochorismatase superfamily hydrolase  34.44 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.579456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>