More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2986 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  96.08 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  67.17 
 
 		 203 aa  295  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  60.8 
 
 		 208 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  59 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  52 
 
 		 203 aa  250  9.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  52 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  51.24 
 
 		 203 aa  246  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  61.11 
 
 		 181 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 203 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 		 194 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 		 194 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  49.45 
 
 		 192 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  45.59 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  48.91 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  48.94 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  38.02 
 
 		 171 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  39.62 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  29.03 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  24.06 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  26.49 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  26.2 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.4 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  22.22 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  38.67 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  37.84 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  26.14 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.56 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.91 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  32.18 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  34.67 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  35.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  27.34 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  36.36 
 
 		 96 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1787  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1834  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.32 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1768  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  35.14 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  38.03 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1499  isochorismatase hydrolase  36.7 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  35.71 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  25.76 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  31.17 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0636  isochorismatase hydrolase family protein  32.29 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.521489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  38.75 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06631  isochorismatase hydrolase family protein  30.25 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2458  isochorismatase hydrolase  44.07 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  31.43 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  39.06 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  25.58 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  40.91 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  43.1 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  33.73 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>