49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30640 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  48.39 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  41.11 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 180 aa  121  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  26.2 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  26.38 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  52 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  52 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  34.83 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  48.08 
 
 		 220 aa  44.7  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.11 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  48.94 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  44 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  35.29 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  37.25 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  32.22 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  42.86 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 200 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 		 243 aa  42  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  40.82 
 
 		 247 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1270  isochorismatase hydrolase  27.85 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  42 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 		 226 aa  41.2  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>