49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4929 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 180 aa  361  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  51.14 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  46.15 
 
 		 215 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  37.97 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  39.11 
 
 		 204 aa  121  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 203 aa  84.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  37.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  25.29 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  35.05 
 
 		 96 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 218 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 214 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  25.81 
 
 		 227 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 218 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 235 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  35.14 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.66 
 
 		 213 aa  41.2  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 235 aa  41.2  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  35.71 
 
 		 217 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  27.71 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  27.71 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  27.71 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  27.71 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  27.71 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  44.07 
 
 		 227 aa  40.8  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 217 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>