More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0906 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 222 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  44.72 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  41.27 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  45.96 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  32.83 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  38.01 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  28.97 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.94 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  29.56 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  26 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.78 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.78 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  28.78 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  27.36 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.78 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.78 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  30.11 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  29.91 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  29.81 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.29 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  28.43 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  27.69 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  36.89 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 203 aa  62  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  26.57 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.12 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.8 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  28.23 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  27.84 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  24.12 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.23 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  27.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  26.98 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  26.98 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  26.98 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  26.98 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  26.98 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  31.52 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  24.47 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>