More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  100 
 
 
197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 
188 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 
180 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  38.75 
 
 
204 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 
213 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
201 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 
203 aa  84.3  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 
192 aa  79  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  35 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  30.34 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  30.34 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  30.34 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  34.81 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  28.07 
 
 
258 aa  71.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  34.18 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  34.18 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  34.35 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  34.18 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  27.73 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  36.54 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  32.48 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  36.54 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  35.62 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  38.53 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  36.54 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  36.54 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  36.54 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  33.54 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  36.54 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  34.53 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 
231 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  34.18 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.57 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.65 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  35.58 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  24 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  26.35 
 
 
211 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 
231 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  34.65 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  34.65 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  41.43 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  44.29 
 
 
248 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  44.29 
 
 
248 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 
258 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  29.26 
 
 
190 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  36.27 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  25.47 
 
 
233 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  29.95 
 
 
274 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 
237 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  36.27 
 
 
199 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  29.17 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
174 aa  61.2  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  38.27 
 
 
102 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 
231 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  29.17 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  27.81 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>