284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0156 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 182 aa  380  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  78.45 
 
 		 181 aa  307  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  52.75 
 
 		 182 aa  197  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  53.3 
 
 		 183 aa  197  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  53.8 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  52.2 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  48.62 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  49.17 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  49.17 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  49.17 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  50.55 
 
 		 184 aa  187  8e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  48.62 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  51.1 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  48.07 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  48.62 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  48.62 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  48.35 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  50 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  48.9 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  48.9 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 178 aa  124  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  46.53 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.38 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.38 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.14 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.51 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.36 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0168  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  37.18 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  37.18 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  37.18 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  29.19 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  29.03 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  29.03 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  30.72 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  29.03 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  29.57 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  28.18 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 377 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  29.03 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  25.48 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  29.87 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 215 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  46.55 
 
 		 235 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  27.56 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  29.89 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  36.9 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  32.29 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.75 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  36.9 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  29.75 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  27.01 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  27.12 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.62 
 
 		 319 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  27.03 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  37.1 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  25.14 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>