138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0168 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0168  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
223 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0226  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 
150 aa  60.1  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  37.5 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 
172 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.01 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 
184 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  25.48 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  30.19 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  32.53 
 
 
181 aa  51.6  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03809  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03770)  30.77 
 
 
155 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.347235  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  36.14 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  36.14 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  36.14 
 
 
182 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.73 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.73 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  24.73 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  24.73 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  29.3 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.73 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.73 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.73 
 
 
213 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  36.14 
 
 
182 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  36.14 
 
 
182 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.73 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  24.85 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.73 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  24.85 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  26.57 
 
 
237 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  36.51 
 
 
194 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  36.14 
 
 
182 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2974  hypothetical protein  37.74 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00851902  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  27.45 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  24.27 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  33.8 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1270  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  27.63 
 
 
313 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  34.94 
 
 
182 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  41.38 
 
 
102 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  26.76 
 
 
186 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 
183 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  39.29 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  34.52 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  22.78 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.92 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0055  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 
180 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154479  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  34.25 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 
184 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 
193 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 
174 aa  45.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  24.84 
 
 
181 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  30.86 
 
 
316 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
174 aa  45.1  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 
188 aa  45.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  33.85 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  34.25 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  33.85 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  33.85 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1181  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35365  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  25.62 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3089  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  32.95 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  31.94 
 
 
359 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  37.1 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.28 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  24.38 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  25.61 
 
 
174 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  26.14 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  35.29 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  30.56 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  23.39 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  30.56 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  30.83 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  30.77 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.94 
 
 
359 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>