More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2121 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
174 aa  357  5e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  64.88 
 
 
172 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  48.52 
 
 
178 aa  185  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  53.7 
 
 
172 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  50 
 
 
177 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  37.33 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  36.62 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  37.24 
 
 
182 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 
181 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
342 aa  91.7  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  35.86 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
193 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  34.53 
 
 
313 aa  89  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 
193 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.95 
 
 
359 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  33.8 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  35.09 
 
 
176 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  32.39 
 
 
181 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  34.3 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  34.3 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  34.3 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  31.94 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  32.87 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 
240 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  31.82 
 
 
359 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 
316 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  32.39 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  34.53 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  37.06 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  32.39 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  31.69 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 
223 aa  82  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.69 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  30.28 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.28 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  30.28 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
203 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  30.14 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
228 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
289 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  31.97 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  28.48 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.21 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 
231 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
231 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 
231 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  34.44 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  30.41 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  30.54 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  30.95 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.17 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
209 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
234 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>