More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1085 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1085  amidase  100 
 
 
181 aa  378  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  78.45 
 
 
182 aa  307  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  56.59 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  53.85 
 
 
183 aa  210  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  53.04 
 
 
182 aa  207  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  53.59 
 
 
182 aa  207  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  54.44 
 
 
185 aa  206  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  52.49 
 
 
182 aa  205  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  51.93 
 
 
182 aa  204  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  54.95 
 
 
184 aa  204  6e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  53.3 
 
 
183 aa  203  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  52.49 
 
 
182 aa  202  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  52.49 
 
 
182 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  54.75 
 
 
186 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  52.49 
 
 
182 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  54.75 
 
 
186 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  53.63 
 
 
184 aa  201  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  51.93 
 
 
182 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  52.75 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  52.75 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 
178 aa  140  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 
180 aa  140  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  50.5 
 
 
102 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
185 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 
193 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 
174 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.09 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  34.67 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 
201 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  30.77 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  30.51 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.32 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 
216 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.57 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  26.47 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
204 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.16 
 
 
213 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.16 
 
 
213 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.16 
 
 
213 aa  61.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1792  isochorismatase family protein  29.65 
 
 
175 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.1134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 
189 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 
189 aa  60.8  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
237 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0388  conserved hypothetical protein, putative amidase  28.81 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  25.96 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.64 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.67 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  27.67 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  29.14 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.67 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  27.67 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.67 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.1 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  27.53 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  26.7 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  28.07 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.61 
 
 
218 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.61 
 
 
218 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.61 
 
 
218 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  29.25 
 
 
197 aa  58.2  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  29.05 
 
 
201 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.49 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
213 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.13 
 
 
218 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  38.46 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  26.46 
 
 
191 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  29.28 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  29.33 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  30.6 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>