More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  86.01 
 
 		 193 aa  342  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  56.74 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  56.11 
 
 		 188 aa  204  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  55.87 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  55.11 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  54.89 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  46.02 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  42.61 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  45.2 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  37.99 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  37.99 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  37.99 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  38.55 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  37.99 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  37.43 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  37.43 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  37.43 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  39.67 
 
 		 185 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  38.07 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  37.85 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  36.41 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.84 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.91 
 
 		 182 aa  91.7  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  30.73 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.73 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  30.73 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  34.25 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.89 
 
 		 359 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2494  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  29.61 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  34.06 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  31.64 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  34.27 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  33.72 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  31.05 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  30.65 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  31.58 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.88 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.88 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.88 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  31.16 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.26 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  35.51 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  35.51 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  35.51 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  30.29 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  29.48 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  29.71 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  30.86 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  32.76 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  29.71 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  35.57 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>