155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0612 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0612  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  29.6 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  32.17 
 
 		 180 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  34.94 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  37.25 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  40.35 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  34.44 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  36.27 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  36.27 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  30.09 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  34.41 
 
 		 185 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  31.19 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  39.47 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  30.47 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  31.82 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  24.34 
 
 		 185 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  23.68 
 
 		 184 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  29.82 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  40.35 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  36.94 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 201 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  31.45 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.64 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  32.65 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  34.58 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  38.81 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  34.21 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  23.03 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  34.21 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  34.21 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.63 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  33.75 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  34.21 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  34.21 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  26.04 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 194 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  34.57 
 
 		 377 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  27.37 
 
 		 184 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  26.17 
 
 		 184 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  23.03 
 
 		 184 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  23.03 
 
 		 184 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  23.03 
 
 		 184 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 215 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  35.44 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 		 190 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  23.03 
 
 		 185 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 289 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 234 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 210 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  33.33 
 
 		 231 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  25.21 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  33.8 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  25.32 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  41.82 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>