296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2922 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  73.89 
 
 		 188 aa  284  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  71.81 
 
 		 188 aa  278  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  71.28 
 
 		 188 aa  274  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  70.33 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  60 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  63.48 
 
 		 197 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  56.98 
 
 		 188 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  55.56 
 
 		 202 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  51.67 
 
 		 183 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  53.98 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  53.07 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  53.49 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  42.54 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  40.21 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  38.02 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  36.79 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  33.16 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  33.16 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.97 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  31.52 
 
 		 184 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.97 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.97 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  31.89 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  31.67 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  32.07 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  32.6 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  37.86 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  31.69 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  26.52 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  34.3 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  35.17 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  32.59 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  30 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 240 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  29.81 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  35.79 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  29.55 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  31.76 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  31.25 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  27.97 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.24 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.1 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2494  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  27.72 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  30.73 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>