More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2169 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  64.62 
 
 		 199 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  63.92 
 
 		 194 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  55.67 
 
 		 183 aa  194  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  41.54 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  42.42 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  42.41 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  40.84 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  40.93 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  40.2 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  38.97 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  36.6 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  40.21 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  31.91 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  36.3 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  36.99 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  37.84 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  29.53 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  29.53 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  29.53 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  29.53 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  34.06 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  37.16 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  29.9 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  29.02 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  28.5 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  30.73 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  30.5 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  32.32 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 		 164 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  28.98 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  30.82 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  29.08 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  29.08 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  35.76 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  29.08 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.51 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  32.98 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  30.77 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  36.73 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  31.9 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  32.39 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>