259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3001 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  79.35 
 
 		 188 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  75.54 
 
 		 197 aa  291  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  71.74 
 
 		 194 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  56.11 
 
 		 188 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  56.67 
 
 		 186 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  55 
 
 		 188 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  52.49 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  54.44 
 
 		 188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  55.56 
 
 		 188 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  49.44 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  49.44 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  40.93 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.07 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.09 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.07 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.07 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  31.18 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  30.98 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  30.43 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  29.35 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 		 180 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  31.22 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 		 180 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 		 180 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  30.16 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  27.47 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  26.46 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  32.1 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  30.65 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  32.09 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  29.44 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 		 342 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  31.95 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.52 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  26.94 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  36.49 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  27.78 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  31.35 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  26.84 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.95 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.95 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.95 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  32.2 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  33.14 
 
 		 359 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  30.11 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  31.91 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>