More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3260 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  91.43 
 
 		 210 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  78.95 
 
 		 209 aa  338  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  71.78 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  71.78 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  64.71 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  64.71 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  63.02 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  63.54 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  63.96 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  63.05 
 
 		 209 aa  249  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  62.5 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  64.71 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  64.71 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  64.71 
 
 		 221 aa  247  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  56.85 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  50.72 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  49.73 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  48.89 
 
 		 342 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  46.99 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  46.74 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  47.26 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 		 231 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 		 231 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 		 289 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  38.85 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 181 aa  91.7  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  32.57 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  35.03 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  29.12 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  37.02 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  39.72 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  30.86 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  37.14 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  33.89 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  27.47 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  32.04 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  33.15 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  29.48 
 
 		 359 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  27.87 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  31.06 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  28.42 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  28.42 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  27.87 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  36.62 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  27.87 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.32 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.87 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.07 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  38.57 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  28.42 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  37.27 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  31.15 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>