More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0975 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
172 aa  354  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  54.88 
 
 
172 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  53.7 
 
 
174 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  44.05 
 
 
178 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  44.31 
 
 
177 aa  157  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  38.78 
 
 
184 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  35.81 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
186 aa  97.4  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 
181 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  35.17 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  36.55 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  36.55 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  35.86 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  34.48 
 
 
187 aa  91.3  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  34.48 
 
 
187 aa  91.3  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  34.48 
 
 
187 aa  91.3  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 
240 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  35.17 
 
 
187 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
203 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
211 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 
217 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
211 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  35.17 
 
 
181 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  33.79 
 
 
181 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.86 
 
 
203 aa  87.8  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  37.24 
 
 
182 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 
182 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  35.97 
 
 
313 aa  87.4  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  38.93 
 
 
182 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  38.03 
 
 
221 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  38.03 
 
 
221 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  34.9 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  35.97 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  37.86 
 
 
221 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  35.46 
 
 
216 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  34.03 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 
231 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  32.62 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.91 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  31.91 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  29.66 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.91 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.91 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  34.48 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  27.85 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
289 aa  74.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.21 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  29.79 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  29.08 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.17 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  35.17 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.8 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  30.28 
 
 
184 aa  67.4  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 
214 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  29.75 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  35.17 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  29.41 
 
 
204 aa  64.3  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.75 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 
237 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  29.73 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 
209 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 
196 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
234 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>