236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4081 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
193 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  63.02 
 
 
210 aa  253  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  62.77 
 
 
219 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  62.77 
 
 
219 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  61.26 
 
 
209 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  64.58 
 
 
210 aa  238  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  62.96 
 
 
209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  62.05 
 
 
221 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  56.22 
 
 
248 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  55.21 
 
 
209 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  61.45 
 
 
221 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  61.45 
 
 
221 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  60.24 
 
 
240 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  59.04 
 
 
217 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  55.21 
 
 
209 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  51.08 
 
 
201 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  46.24 
 
 
211 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  47.9 
 
 
182 aa  151  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  44.26 
 
 
213 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  46.11 
 
 
185 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  43.11 
 
 
187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  43.11 
 
 
342 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  29.94 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  27.11 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  27.11 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  34.23 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  36.28 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  23.35 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  27.61 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2860  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.258884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  27.61 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  27.61 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  28.78 
 
 
359 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 
181 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 
184 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  24.66 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  30.7 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.81 
 
 
359 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
183 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  25.87 
 
 
164 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  29.17 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  31.25 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  26.63 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  27.27 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  27.27 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 
172 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  27.27 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  26.63 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
173 aa  59.3  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 
210 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  36.45 
 
 
244 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 
175 aa  57.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  26.62 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  33.07 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  29.27 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  32.23 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  27.92 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  25.15 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  25.15 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  27.27 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  25.33 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  25.15 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  25.88 
 
 
174 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  26 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  25.44 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  27.46 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  32.23 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  27.78 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  26.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>