More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  95.22 
 
 
209 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  64.71 
 
 
210 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  60.29 
 
 
219 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  60.29 
 
 
219 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  63.24 
 
 
210 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  58.79 
 
 
221 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  58.79 
 
 
221 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  58.79 
 
 
221 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  58.67 
 
 
248 aa  245  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  60.1 
 
 
209 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  55.05 
 
 
240 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  54.55 
 
 
217 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  55.21 
 
 
193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  54.73 
 
 
209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  51.01 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  51.65 
 
 
182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 
185 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  48.35 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  42.42 
 
 
211 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  46.37 
 
 
342 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  43.3 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  38.85 
 
 
231 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  38.85 
 
 
231 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  38.85 
 
 
231 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
203 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 
231 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
289 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  38.13 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 
207 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  32.04 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 
182 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
182 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  29.12 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  29.44 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  29.67 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  35.8 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  28.11 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  36.62 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  28.65 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.21 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  29.67 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  30.21 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  29.67 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  29.69 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.91 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.69 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  29.2 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  29.69 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.91 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  35.17 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.91 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  29.78 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  25.97 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  36.62 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  29.2 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  36.3 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  29.2 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.84 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.81 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  29.2 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  29.2 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  29.2 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  30.11 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  30.65 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  28.57 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>