More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0706 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  91.43 
 
 		 210 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  80.29 
 
 		 209 aa  346  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  71.29 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  71.29 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  63.24 
 
 		 209 aa  264  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  67.76 
 
 		 240 aa  261  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  64.06 
 
 		 217 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4081  isochorismatase hydrolase  64.58 
 
 		 193 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  64.8 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  64.58 
 
 		 221 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  64.58 
 
 		 221 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  64.58 
 
 		 221 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0488  isochorismatase hydrolase  63.86 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  63.24 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  57.36 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  52.17 
 
 		 211 aa  214  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  50.82 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  48.33 
 
 		 342 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  46.7 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  45.36 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2726  isochorismatase hydrolase  47.76 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 		 289 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  40.29 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  40.29 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  40.29 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 		 231 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  35.03 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30.22 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  32 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  30.68 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  38.1 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  34.1 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  33.14 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  31.16 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  27.07 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  32.57 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 182 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 183 aa  72  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  30.39 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  28.42 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  27.78 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  28.42 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  35.47 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.62 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  27.78 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2860  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.258884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  29.78 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  27.75 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  37.27 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  27.75 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  28.25 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>