More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0721 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
182 aa  373  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  81.87 
 
 
182 aa  312  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  56.11 
 
 
182 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  58.01 
 
 
184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  53.85 
 
 
181 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  54.55 
 
 
210 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  55.11 
 
 
181 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  55 
 
 
190 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  50.83 
 
 
193 aa  191  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  50.57 
 
 
181 aa  189  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  50.57 
 
 
181 aa  188  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  50.29 
 
 
193 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  48.86 
 
 
187 aa  184  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  48.86 
 
 
187 aa  184  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  48.86 
 
 
187 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  48.86 
 
 
187 aa  184  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  48.86 
 
 
187 aa  184  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  48.3 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  48.3 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  54.44 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  48 
 
 
181 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  47.73 
 
 
181 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  52.27 
 
 
182 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  54.72 
 
 
182 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  54.4 
 
 
190 aa  174  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  54.09 
 
 
182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  45.14 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  46.43 
 
 
186 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  44.69 
 
 
185 aa  158  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  43.33 
 
 
185 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  44.97 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  43.45 
 
 
199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 
181 aa  141  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  36 
 
 
316 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 
223 aa  124  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  37.22 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 
201 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 
203 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 
313 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  35.37 
 
 
180 aa  111  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 
342 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  32.22 
 
 
216 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 
203 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 
203 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 
198 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 
203 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  35.56 
 
 
200 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 
196 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
316 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 
196 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  34.73 
 
 
198 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  37.8 
 
 
196 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 
231 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
196 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 
231 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 
231 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 
231 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 
199 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 
199 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 
199 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 
199 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  29.21 
 
 
182 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
289 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  32.93 
 
 
198 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 
199 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
228 aa  92  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 
217 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
199 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
240 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 
185 aa  90.9  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 
221 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 
221 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 
199 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 
199 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 
221 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
248 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 
172 aa  87.8  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
219 aa  87.8  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
219 aa  87.8  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  29.28 
 
 
177 aa  85.1  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  29.94 
 
 
191 aa  85.1  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  34.73 
 
 
198 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
234 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
199 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  29.71 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  27.84 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  34.07 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  34.72 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>