More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3884 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
199 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  81.91 
 
 
199 aa  309  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  76.65 
 
 
199 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  76.14 
 
 
199 aa  284  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  77.16 
 
 
199 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  58.6 
 
 
198 aa  231  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  54.64 
 
 
200 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  63.32 
 
 
199 aa  214  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  56.92 
 
 
199 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  56.92 
 
 
199 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  56.92 
 
 
199 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  52.26 
 
 
207 aa  184  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  57.58 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  60.62 
 
 
200 aa  181  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  50.52 
 
 
196 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  43.75 
 
 
198 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  47.67 
 
 
198 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  49.2 
 
 
197 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  48.42 
 
 
198 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  42.71 
 
 
198 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  43.37 
 
 
223 aa  147  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  40.84 
 
 
196 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  40.31 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 
196 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  42.19 
 
 
196 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  41.67 
 
 
196 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
196 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 
196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  39.18 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  42.47 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  39.18 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  44.92 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  40.82 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  42.33 
 
 
207 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 
206 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 
193 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  46.88 
 
 
210 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  41.11 
 
 
181 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  40.12 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  40.11 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  38.64 
 
 
181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 
211 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 
211 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  44.19 
 
 
186 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  44.97 
 
 
199 aa  118  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
231 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  40.78 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  37.5 
 
 
181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  40.64 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 
203 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  37.21 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.63 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  37.77 
 
 
289 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  37.14 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  37.14 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  37.14 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  37.79 
 
 
187 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  37.79 
 
 
187 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 
218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  43.1 
 
 
182 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 
182 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  33.91 
 
 
185 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  39.77 
 
 
210 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
234 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
180 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
180 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
180 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 
182 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 
184 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
182 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
180 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
194 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  30.68 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  34.09 
 
 
184 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  34.66 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  34.66 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  34.09 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  34.09 
 
 
185 aa  95.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 
172 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 
190 aa  94.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
190 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  33.52 
 
 
185 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 
184 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  37.14 
 
 
193 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  33.52 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  33.52 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>