More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0044 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 201 aa  416  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  92.04 
 
 		 201 aa  385  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  40.93 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  43.37 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  38.14 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 		 196 aa  141  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  38.07 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 223 aa  131  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  38.07 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  40.2 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  40.2 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  38.19 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  40.31 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  37.88 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  37.88 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  37.88 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  40.31 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  38.42 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  41.34 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  38.42 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  37.85 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  36.98 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  37.29 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  37.29 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  37.29 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  37.29 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  39.58 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 181 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  36.72 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  38.37 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 193 aa  121  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  34.85 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  39.18 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  35.59 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  41.33 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  31.5 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  41.48 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 193 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  38.86 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  37.93 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  38.07 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  33.7 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 289 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 181 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  34.72 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  36.6 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  37.71 
 
 		 190 aa  95.9  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  34.66 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  28.81 
 
 		 185 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 182 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  39.01 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  27.68 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  27.68 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  26.97 
 
 		 184 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  27.68 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  27.68 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  28.33 
 
 		 184 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  28.49 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  36.24 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>