211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4299 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  90.96 
 
 
188 aa  351  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  72.34 
 
 
188 aa  280  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  71.28 
 
 
188 aa  274  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  71.82 
 
 
188 aa  265  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  62.5 
 
 
186 aa  227  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  61.54 
 
 
197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  57.54 
 
 
188 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  56.98 
 
 
194 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  56.11 
 
 
202 aa  197  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  51.72 
 
 
179 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  48.57 
 
 
183 aa  177  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  48.57 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 
183 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 
211 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 
194 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  30.27 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  30.05 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  30.27 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  30.05 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  30.05 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  29.51 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  30.34 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  30.9 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  31.72 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  29.21 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  25.28 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  28.26 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  27.73 
 
 
230 aa  61.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
187 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  26.23 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
199 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  28.1 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 
210 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
203 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  36.27 
 
 
209 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
342 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  25.79 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  33.58 
 
 
198 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
234 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 
198 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
201 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 
231 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  31.54 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 
231 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  27.45 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 
231 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  28.06 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
232 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 
202 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 
184 aa  52  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  27.85 
 
 
182 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  29.25 
 
 
185 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  27.11 
 
 
258 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  27.4 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  27.22 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>