201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4511 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
185 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  78.21 
 
 
179 aa  289  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 
179 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 
179 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 
179 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  50.29 
 
 
179 aa  170  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  48.28 
 
 
187 aa  162  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
195 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  31.43 
 
 
179 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  30.86 
 
 
179 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  30.86 
 
 
179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  30.99 
 
 
179 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  30.29 
 
 
179 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  30.29 
 
 
179 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  30.29 
 
 
179 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  30.29 
 
 
179 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  30.86 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 
194 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 
201 aa  74.3  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
215 aa  61.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  32.41 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  32.41 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  32.41 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 
235 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 
224 aa  58.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 
228 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 
207 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  26.01 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  23.08 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  33.99 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 
235 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  26.52 
 
 
329 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 
204 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 
204 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  26.01 
 
 
174 aa  52  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  24.42 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  26.11 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 
237 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  30.59 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  29.01 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  35.16 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  27.17 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 
228 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  41.89 
 
 
230 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 
224 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
208 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  23.84 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 
233 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  42.42 
 
 
248 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
196 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  42.42 
 
 
248 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  43.94 
 
 
247 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
183 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  32.53 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 
188 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  39.39 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  33.65 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  22.09 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 
216 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 
230 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  24.16 
 
 
188 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>