More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1893 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 188 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  87.1 
 
 		 188 aa  344  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  67.03 
 
 		 185 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  62.5 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  59.76 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  56.18 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  56.74 
 
 		 193 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  44.69 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  43.58 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  39.55 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  40.66 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  39.55 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  39.55 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  38.98 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  38.98 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  38.98 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  37.85 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  38.42 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  37.16 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  38.8 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  32.61 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  30.73 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.73 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  30.73 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.34 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  29.61 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 289 aa  85.5  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2494  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  32.82 
 
 		 230 aa  84.3  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  28.98 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  31.49 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  28.65 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  27.68 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  29.94 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  29.94 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  32.84 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  28.41 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  29.12 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 203 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  37.62 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  29.1 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>