More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1215 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  67.03 
 
 		 188 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  63.39 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  62.98 
 
 		 191 aa  227  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  59.17 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  55.11 
 
 		 193 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  52.22 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  44.63 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  44.07 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  44.07 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  43.5 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  43.5 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  42.13 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  43.5 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  42.37 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  42.37 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 195 aa  140  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 201 aa  94.4  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  30.34 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  30.9 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  32.58 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 207 aa  90.9  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  31.49 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  38.26 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  29.78 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.78 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  29.78 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.21 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  29.78 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  29.78 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 231 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 231 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 203 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  33.15 
 
 		 196 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 196 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  31.58 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 231 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  85.9  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 231 aa  84.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 203 aa  84.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  30.27 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  30.56 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  28.25 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  28.32 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2494  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  31.98 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.62 
 
 		 359 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  27.73 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  33.85 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>