More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0208 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  99.47 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  99.47 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  93.68 
 
 		 190 aa  352  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  38.93 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  38.22 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  35.29 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  33.83 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.88 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.26 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.03 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.27 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  32.12 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  38.14 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  34.51 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.2 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  33.54 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  28.65 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  31.41 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  38.64 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  38.64 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  38.64 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  38.64 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  38.64 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  31.72 
 
 		 533 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  33.59 
 
 		 222 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  35.35 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  35.35 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.61 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  36.89 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  35.35 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  35.35 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  35.35 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  35.35 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  41.38 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  35.35 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  35.35 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  32.19 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  39.02 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  51.61 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  33.59 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.95 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  30.23 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 239 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.72 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  28.25 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  44.05 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>