177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C36 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008505  LACR_C36  amidase  100 
 
 
207 aa  434  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  46.86 
 
 
250 aa  198  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  44.34 
 
 
215 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 
214 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  30 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  25.4 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  24.29 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  23.94 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  24.12 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  26.53 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  24.12 
 
 
239 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  25.96 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  26.4 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  24.19 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  37.18 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  37.18 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  37.18 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  37.18 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  37.18 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  24.12 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  37.18 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  37.18 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  24.89 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  35.9 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  27.31 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  24.49 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  25.89 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  24.88 
 
 
225 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  40.79 
 
 
207 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
230 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  26.06 
 
 
389 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.38 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  31.4 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  24.35 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  25.67 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  23.77 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  28.93 
 
 
316 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  37.18 
 
 
246 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  23.53 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 
234 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  24.21 
 
 
240 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
204 aa  48.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 
289 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  25.54 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  23.39 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  35.48 
 
 
96 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  21.23 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  23.46 
 
 
222 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  21.99 
 
 
224 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  23.61 
 
 
274 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  24 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 
247 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  25.14 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  27.87 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  27.87 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  25 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  24.58 
 
 
186 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  29.92 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  27.87 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  23.76 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  21.21 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
247 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  26.96 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  22.27 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  37.66 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  22.65 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>