171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1100 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 215 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  57.21 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  58.29 
 
 		 214 aa  244  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  44.34 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  26.05 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.02 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  26.05 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  25.96 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.42 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  29.44 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.34 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 329 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  26.63 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.05 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.05 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  26.82 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.05 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.05 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  27.17 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  29.05 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  27.12 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  25.91 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.52 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  34.94 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  26.88 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  32.54 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  34.15 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.57 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  24.44 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  31.97 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  26.52 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  27.7 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  23.2 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  40.38 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  24.35 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  44.9 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  44.9 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  44.9 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  31.36 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  44.9 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  44.9 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  45.83 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  45.83 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  23.96 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  45.83 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  23.96 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  45.83 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  45.83 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  45.83 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  45.83 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  29.49 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.49 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  29.49 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  40.98 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  32.05 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  29.49 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  23.96 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  29.49 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  29.49 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  39.34 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  23.96 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  32.05 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  40.43 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  39.34 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>