120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1616 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  100 
 
 		 250 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  57.21 
 
 		 215 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  59.43 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  46.86 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  25.24 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.47 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  27.45 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  26.87 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  25.25 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  25.25 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  39.02 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  26.63 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  26.46 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  27.12 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  25 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  27.08 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  23.62 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  25.63 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  24.09 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  24.14 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  46.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  46.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  46.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  46.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  38.81 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  46.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  46.94 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  46.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  46.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.38 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  24.44 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  45.1 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 377 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  31.63 
 
 		 195 aa  48.5  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  24.73 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  26.42 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  25.54 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  26.09 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  32.56 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  30 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  23.73 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  24.08 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  25.55 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  23.18 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  24.31 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  23.04 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  23.04 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  23.32 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  23.6 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  24.41 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  27.78 
 
 		 184 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  24.49 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  25.67 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  26.05 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  36.54 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  38.78 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  23.91 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  24.31 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  27.78 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  27.57 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  20.54 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  23.66 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>