More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0690 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  74 
 
 		 201 aa  299  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  60.1 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  62.18 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  49.26 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  49.74 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  33.84 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 329 aa  81.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  34.08 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  30.05 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  30.43 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.55 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.96 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.67 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  31.68 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.69 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  33.16 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  34.22 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  33.51 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.73 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  31.87 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  31.69 
 
 		 533 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  37.96 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  29.26 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.55 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  37.96 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.05 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  29.03 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  31.52 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  29.44 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  32.14 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.67 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  32.6 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  30.16 
 
 		 284 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 258 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  27.6 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  27.6 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>