More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2950 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  70.65 
 
 		 187 aa  260  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  62.84 
 
 		 187 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  61.75 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  62.37 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  61.2 
 
 		 191 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  61.75 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  60.11 
 
 		 187 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  59.56 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  61.2 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  61.2 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  61.2 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  59.02 
 
 		 187 aa  214  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  58.47 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  49.49 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  48.07 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  47.47 
 
 		 204 aa  164  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  38.92 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  38.38 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  38.38 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  39.89 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  41.05 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  40.93 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  42.02 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  39.56 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  37.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  37.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  37.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  37.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  37.7 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  37.91 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  37.91 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  37.91 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  37.91 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  37.91 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  37.91 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  37.91 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  35.33 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  42 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  38.41 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  34.1 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  35.86 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.41 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  30.05 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  40.21 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  35.19 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  23.81 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  26.18 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.67 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  37 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  31.77 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  26.63 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  27.69 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  25.65 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  24.84 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  32.38 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  25.65 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>