More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2020 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  100 
 
 		 327 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  50.17 
 
 		 295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  50.17 
 
 		 295 aa  328  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  50.17 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  50.17 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  50.99 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  50.17 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  50.66 
 
 		 297 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  50.17 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  50.33 
 
 		 297 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  50 
 
 		 297 aa  322  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  49.34 
 
 		 297 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  48.5 
 
 		 284 aa  312  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  51.67 
 
 		 291 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  46.84 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  47.67 
 
 		 291 aa  298  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  48.67 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  49.83 
 
 		 278 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  49.16 
 
 		 285 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  46.84 
 
 		 284 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  46.05 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  49.17 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  47.87 
 
 		 291 aa  285  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  46.18 
 
 		 285 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  45.85 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  45.85 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  45.85 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  45.85 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  45.85 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  45.85 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  46.18 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  45.85 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  46.51 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  44.37 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  46.51 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  46.51 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  46.51 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  46.18 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.12 
 
 		 319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  43.37 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  43.04 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  43.85 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  42.05 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  43.71 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  53.81 
 
 		 212 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  53.62 
 
 		 207 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  52.86 
 
 		 251 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  52.86 
 
 		 221 aa  228  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  41.88 
 
 		 264 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  52.47 
 
 		 221 aa  222  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  50.24 
 
 		 216 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  53.4 
 
 		 220 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  50.72 
 
 		 207 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  50.72 
 
 		 207 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  50.24 
 
 		 207 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  50 
 
 		 207 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  50 
 
 		 207 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  48.57 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  48.6 
 
 		 218 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  46.67 
 
 		 211 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  47.89 
 
 		 201 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  40.32 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  46.08 
 
 		 1678 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1868  isochorismatase  55.56 
 
 		 84 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3692  phosphopantetheine-binding protein  49.28 
 
 		 80 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20840  aryl carrier domain protein  52 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  decreased coverage  0.00638863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  27.96 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  45.71 
 
 		 1131 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  50 
 
 		 1436 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 192 aa  67  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  43.24 
 
 		 2174 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  39.02 
 
 		 2230 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  40.79 
 
 		 2350 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  28.95 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  46.25 
 
 		 1438 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 188 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  30.17 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  38.89 
 
 		 1174 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  30.17 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  39.81 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  30.17 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  30.17 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  30.17 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.5 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  41.76 
 
 		 1414 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>