More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1316 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  77.19 
 
 
291 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  71.23 
 
 
287 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  68.53 
 
 
284 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  66.32 
 
 
285 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  65.61 
 
 
285 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  66.32 
 
 
285 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  65.96 
 
 
285 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  65.61 
 
 
284 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  65.96 
 
 
285 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  60.07 
 
 
291 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  60.49 
 
 
283 aa  350  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  52.54 
 
 
294 aa  316  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  52.4 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  52.4 
 
 
290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  51.84 
 
 
296 aa  299  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  49.65 
 
 
295 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  50 
 
 
295 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  49.65 
 
 
295 aa  289  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  49.65 
 
 
295 aa  289  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  53.42 
 
 
291 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  49.31 
 
 
295 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  49.31 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  50.89 
 
 
285 aa  285  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  48.64 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  50.36 
 
 
278 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  48.31 
 
 
297 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  47.96 
 
 
297 aa  279  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  48.47 
 
 
297 aa  279  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  47.93 
 
 
299 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  48.2 
 
 
327 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  46.94 
 
 
297 aa  275  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  48.76 
 
 
270 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  45.83 
 
 
293 aa  254  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.42 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  52.38 
 
 
212 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  49.76 
 
 
207 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  49.76 
 
 
207 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  50 
 
 
207 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  49.78 
 
 
221 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  49.51 
 
 
207 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  52.13 
 
 
218 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  49.51 
 
 
207 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  48.06 
 
 
207 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  52.61 
 
 
207 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  50.24 
 
 
251 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  42.29 
 
 
264 aa  205  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  47.62 
 
 
221 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  49.04 
 
 
220 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  47.69 
 
 
216 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  48.34 
 
 
211 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  45.24 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  40.78 
 
 
260 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 
193 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 
180 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 
192 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.37 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  24.73 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 
194 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 
194 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  31.22 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  31.22 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  31.22 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  31.22 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  31.22 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.88 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
203 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 
185 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 
201 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 
200 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
218 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  25.89 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2717  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>