More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3031 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  99.65 
 
 
285 aa  590  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  99.65 
 
 
285 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  99.65 
 
 
285 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  99.65 
 
 
285 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  98.6 
 
 
285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  88.42 
 
 
285 aa  533  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  88.42 
 
 
285 aa  533  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  88.42 
 
 
285 aa  533  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  88.07 
 
 
285 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  88.07 
 
 
285 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  85.96 
 
 
284 aa  522  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  72.7 
 
 
284 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  62.9 
 
 
283 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  66.08 
 
 
291 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  60.7 
 
 
287 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  62.94 
 
 
291 aa  364  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  61.4 
 
 
291 aa  352  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  50.35 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  51.57 
 
 
290 aa  294  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  51.22 
 
 
290 aa  289  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  47.3 
 
 
296 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  50.35 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  50.68 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  49.46 
 
 
285 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  45.39 
 
 
297 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  44.9 
 
 
297 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  44.9 
 
 
297 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  44.9 
 
 
297 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  45.86 
 
 
295 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  45.58 
 
 
295 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  45.86 
 
 
295 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  44.71 
 
 
297 aa  265  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  46.91 
 
 
278 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  44.56 
 
 
295 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  44.9 
 
 
295 aa  262  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  45.17 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  45.85 
 
 
327 aa  258  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  44.29 
 
 
293 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.9 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  44.64 
 
 
270 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  51.46 
 
 
207 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  47.37 
 
 
212 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  52.91 
 
 
207 aa  215  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  49.32 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  47.83 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  50.96 
 
 
216 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  46.6 
 
 
207 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  46.12 
 
 
207 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  41.18 
 
 
264 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  46.12 
 
 
207 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  49.21 
 
 
220 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  46.12 
 
 
207 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  46.12 
 
 
207 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  45.67 
 
 
211 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  45.45 
 
 
218 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  44.02 
 
 
221 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  39.13 
 
 
201 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  36.41 
 
 
260 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
180 aa  89.7  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 
194 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 
194 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
190 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
201 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
201 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  25.41 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.56 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
184 aa  67  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 
224 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
174 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
172 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 
185 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  27.71 
 
 
179 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  27.81 
 
 
179 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  22.43 
 
 
227 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
189 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  27.81 
 
 
179 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 
199 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 
224 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 
193 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  27.71 
 
 
179 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.71 
 
 
179 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  28.31 
 
 
179 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>